بعد از اینکه یحیی گل‌محمدی به عنوان سرمربی تیم فوتبال پرسپولیس انتخاب شد، کل کادرفنی قبلی از تیم جدا شدند و فقط کریم باقری ماندنی شد.

باقری که نقش موثری در کادرفنی برانکو و حتی کالدرون داشت با حضور در کادرفنی جدید شرایط متفاوتی را تجربه می‌کند. با اینکه هم یحیی گل‌محمدی و هم حمید مطهری بار‌ها اعلام کردند که از حضور باقری در پرسپولیس استقبال می‌کنند و حتی مطهری در گفت‌وگویی که با خبرگزاری میزان داشت تاکید کرد باقری دوست و رفیق قدیمی و بزرگتر او است، اما شرایط فعلی چیز دیگری را نشان می‌دهد.

باقری بعد از آمدن کادرفنی جدید دیگر در جریان بازی‌ها کنار زمین نمی‌آید و مطهری این مسئولیت را برعهده دارد، این در شرایطی است که باقری در زمان برانکو و کالدرون حضور فعالی کنار زمین و حتی در تمرینات داشت، اما وضعیت الان متفاوت است.

باید دید که آیا باقری با همین شرایط تا آخر فصل در پرسپولیس می‌ماند یا خیر. این در شرایطی است که نقش باقری در کنترل حواشی پرسپولیس در چندسال اخیر زیاد بوده و بازیکنان هم ضمن حساب بردن از او، برای وی احترام فراوانی قائل هستند.